Microbiologie
En fonction des prescriptions, les recherches microbiologiques suivantes seront réalisées par le laboratoire :
Coproculture
Campylobacter sp
Yersinia sp
Shigella sp
Salmonella sp.
Par cultures bactériennes spécifiques ou par biologie moléculaire
La recherche étendue à d’autres agents d’entérites nécessite une prescription explicite.
Recherche de Clostridium difficile
Clostridum difficile
Toxine A et B
– patients âgés de plus de 65 ans
Examen parasitologique des selles
Recherche de parasites, d’œufs et de kystes de parasites
Ne sont pas réalisées les recherches de cryptosporidies qui doivent faire l’objet d’une prescription spécifique
Virologie des selles
Adénovirus
Rotavirus
A réaliser en cas de contexte épidémique évocateur
Le panel des virus testés pourra varier selon les laboratoires
Coproculture : examen bactériologique des selles
Prescription :
Diarrhée aiguë :
Avant de prescrire une coproculture, il faut exclure les causes non infectieuses de diarrhée aiguë.
Une coproculture est suggérée dans des cas spécifiques :
- – Diarrhée hémorragique ou symptômes dysentériques.
- – Signes cliniques de gravité, comme une forte fièvre ou des douleurs abdominales sévères.
- – Patients à risque (âge avancé, insuffisance rénale, immunodépression).
- – Diarrhée persistante plus de trois jours.
- – Probabilité élevée d’une origine bactérienne, comme dans les toxi-infections alimentaires collectives.
Cas particuliers :
Pour des situations telles que le retour d’un pays tropical ou une diarrhée aiguë pendant ou après un traitement antibiotique, des examens plus ciblés sont nécessaires, par exemple la recherche de toxines de C. difficile.
Diarrhée chronique :
Une coproculture n’est pas recommandée sauf pour les patients immunodéprimés. La diarrhée chronique peut avoir des causes non infectieuses.
Interprétation :
La détection de Salmonelles, Shigelles, Campylobacter, ou Yersinia est toujours considérée comme pathologique.
En revanche, la présence d’E. coli, sauf certaines souches spécifiques, n’est généralement pas pathologique.
Examen parasitologique des selles :
Prescription :
Symptômes à considérer :
- – Diarrhée aiguë persistante malgré un traitement symptomatique.
- – Diarrhée chronique ou persistante.
- – Douleurs abdominales, troubles digestifs divers (anorexie, nausées, dyspepsie, prurit anal).
- – Hyperéosinophilie.
Le choix de l’examen dépend de l’histoire clinique du patient, y compris les voyages dans des zones à risque.
Interprétation :
Parasites pathogènes : Identification des parasites susceptibles de causer des symptômes chez l’homme.
La présence de parasites tels que Giardia lamblia, Entamoeba histolytica, ou Cryptosporidium est significative.
Le contexte clinique et épidémiologique du patient oriente vers les parasites les plus probables.
Examen de coprologie fonctionnelle :
Prescription :
Diarrhée aiguë et constipation chronique :
Ces conditions ne justifient généralement pas un examen de coprologie fonctionnelle.
Alternance diarrhée/constipation :
Utile lorsque les symptômes ne sont pas clairement définis par l’interrogatoire.
Diarrhée chronique et suspicion de malabsorption :
L’examen est conseillé si les examens biologiques standards et les explorations morphologiques n’ont pas établi de diagnostic.
Interprétation :
Paramètres clés :
Poids moyen des selles, teneur en matière sèche, présence de stéatorrhée, et autres indicateurs sont utilisés pour diagnostiquer la diarrhée chronique, la malabsorption, ou la maldigestion des graisses.
