POINTS CLÉS EN BIOLOGIE MEDICALE
Recommandation
Dans le contexte de la circulation du SARS-CoV-2 parmi les autres virus respiratoires (le RSV et les virus influenza en particulier) et du fait de l’impossibilité de faire un diagnostic clinique ou radiologique étiologique (hors cluster), il est recommandé de détecter d’emblée au moins les 4 principaux virus respiratoires, c’est-à-dire le SARS-CoV-2, les virus influenza A et B et le RSV, à la fois chez l’enfant et l’adulte.
Le Groupe de travail « virus respiratoires » du Réseau de virologie et pharmacologie médicale de l’ANRS-MIE et un représentant de la SFM se sont réunis afin de lister les indications du dépistage et du diagnostic des infections par les virus respiratoires en milieu hospitalier par utilisation des tests permettant le diagnostic simultané des virus influenza A et B, du RSV et du SARS-CoV-2 (test quadriplex), ainsi que pour recommander le positionnement de ces tests par rapport à un panel virus respiratoires plus étendu (tests multiplex).
Pour mémoire, la composition des panels dépend des fournisseurs et peuvent comprendre, partiellement ou en totalité, en plus des principaux virus (virus influenza A et B, RSV et SARS-CoV-2), les métapneumovirus, les virus parainfluenza, les rhinovirus/entérovirus, les adénovirus, les coronavirus banals (HCoV-229E, HCoV-HKU1, HCoV-NL63 et HCoV-OC43). Certains panels peuvent détecter également des bactéries atypiques (tel que Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae et Bordetella pertussis) ou Legionella spp.
